《调查局:幽浮解密》中共有指挥官、侦查兵、工程师、支援兵和突击兵五大职业,《调查局:幽浮解密》五大职业技能详细介绍:
卡特(指挥官)
Rank1:Alien Exposure(外星人设备曝晒症)Heal(治疗)
Alien Exposure卡特开头时曝晒于外星人设备之下,使他有未知的特别能力。
Heal治疗全体队员。
Rank2:Lift(浮空)Endurance(持久力)
Lift让敌人浮在空中,而且完全无法行动。卡特的神技之一,可用来对付头目级角色或躲在掩体后方的敌人。
Endurance体力最大值增加1格。
游戏背景设定在肯尼迪总统当政的1962年冷战时期,“调查局”将第一次接触神秘的外星敌人,可以说是“幽浮”的前传,原先调查局是为了帮助美国抵抗苏联隐秘攻击的,所以“调查局”随后成为了专门与神秘力量战斗的组织,玩家将扮演特工威廉姆卡特,指挥小队为了人类的生存战斗,不过最高政府却以威胁来自“调查局”,以此平息民众的恐慌。